司法协助通过上述的双边和区域条约、《刑事诉讼法》第 253 条第 3 款、以及第 2004-020 号法进行规范。马达加斯加可在《公约》基础上提供司法协助，但目前尚未有任何案例。
马达加斯加基于惯例，并根据第 2004-020 号法第 43 条第(4)项，使用两国共认犯罪要求。原则上，在非两国共认犯罪情况下，可在《公约》基础上完成司法协助。
马达加斯加可为《公约》中所列的所有目的以及针对法人的程序提供协助，只要所需行动不违反国内法律。这包括请求中列明的程序（第 2004-020 号法第44 条） 。
马达加斯加在无事先请求的情况下获得了信息，根据法律一般原则可对信息保密。至今，它还未自发传递过信息。召开非正式案件协调会议提出司法协助请求，尤其针对涉及多个司法管辖区或权限冲突的案件。
司法部为中央机关。通过外交渠道接受使用法语和马达加斯加语的请求，除非条约另行规定。马达加斯加加入的一些条约允许直接移交至检察官办公室。紧急情况下，可通过国际刑警组织接受请求，传真或电子邮件均可，但不能是口头形式。
第 2004-020 号法第 59 和 62 条规定了保密性和特殊性原则，且作为法律一般原则应用。实践中，通过举行视频会议取证，且立法草案中已纳入这一条。
马达加斯加的司法协助案件平均需要一年时间，最快需要 2-3 个月。2013 年的司法部长通知指示官员将及时执行请求作为优先事项。实践中，根据请求缔约国提出的最后期限执行了请求，且就请求状况提供了信息。马达加斯加官方举例说明他们在拒绝请求前，请求进一步信息或与请求方协商。
第 2004-020 号法第 43 条以及马达加斯加加入的条约载列了基本符合《公约》规定的拒绝司法协助的理由。在这方面，不可援引银行机密作为依据。然而，马达加斯加目前不能对经济罪提供援助；原则上，马达加斯加可以以《公约》为基础处理涉及经济问题的腐败罪。第 2004-020 号法第 43 条规定拒绝援助时必须要给出理由，并规定如果司法协助干扰了国内程序，可推迟司法协助。马达加斯加加入的一些条约保证了依请求国要求提供证据的证人的安全保障。没有立法规定了执行请求的费用；马达加斯加官方确认除非各方另行协定，否则费用由被请求缔约国承担。